(一)合法合規性 　　
部門預算首先要符合《憲法》、《預算法》等法律法規的要求。部門預算的各項收支要充分體現國家有關方針、政策，并在法律賦予部門的職能范圍內編制。具體來講：一是收入要合法合規。組織基金收入要符合國家法律、法規的規定，行政事業性收費要按財政部、國家發改委和價格管理部門核定的收費項目和標準測算等。二是各項支出要符合財政宏觀調控的目標，要遵守現行的各項財務規章制度。 　　
(二)系統完整性 　　
所有收入和支出全部納入部門預算，各種預算外資金要嚴格執行“收支兩條線”管理，改變預算內外資金 “兩張皮”的狀況，取消收支掛鉤的預算核定方法，對單位的預算內、外各項財政資金和其他收入，統一管理，統籌安排，統一編制綜合財政預算。編制預算時，要將部門依法取得的包括所有財政性資金在內的各項收入以及相應的支出作為一個有機整體進行管理，對各項收入、支出預算的編制做到不重不漏，不得在部門預算之外保留其他收支項目。對各項收入支出在執行中要嚴格按照國家、財政部規定的各項收支政策進行管理。 　　
(三)科學合理性 　　
1.預算收支規模的預測和方向要科學。首先收支預測要與國民經濟社會發展狀況相適應，要有利于促進國民經濟協調健康、可持續發展，同時要結合本單位自身收入來源和能力，考慮自身實際的支出需求和結構，合理穩妥地預計收入，安排支出，做到收支平衡，不得編制赤字預算。 　　
2.預算編制要科學。首先合理安排預算編制程序和時間，保證充裕的時間編制預算，保證預算編制質量，提高預算編制的效率;其次，預算編制的方法要科學，預算的編制要制定科學規范的方法，測算的過程要有理有據;第三，預算的核定要科學，基本支出預算定額要依照科學的方法制定，項目支出預算編制中要對項目進行遴選，分輕重緩急排序，科學合理地選擇項目。 　　
3.預算要有前瞻性。在編制過程中要充分考慮項目單位自身在預算年度需求、支出內容和結構，保證預算在執行過程中的可行性和可操作性。避免出現預算與執行差距過大的問題，使預算失去其控制支出、考評執行情況的實際意義。